本學期課程進度

本課程是3學分課程, 共上16週(去掉期中末考所佔時間), 以下是本學期的上課時程與預定進度, 請各位留意:

第01週: 02/22 準備週
第02週: 02/29 課程邏輯
第03週: 03/07 The history of natural history
第04週: 03/14 The beginning and the need of taxonomy
第05週: 03/21 Principles of systematics
第06週: 03/28 What is a species?
第07週: 04/04 Phylogenetic reconstruction: morphological characters
第08週: 04/11 Phylogenetic reconstruction: molecular characters
第09週: 04/18 Phylogenetic reconstruction: tree building
第10週: 04/25 Phylogenetic reconstruction: comparing hypotheses
第11週: 05/02 Applied phylogenetics: evolutionary ecology
第12週: 05/09 Applied phylogenetics: biogeography
第13週: 05/16 Applied phylogenetics: other field
第14週: 05/23 Biodiversity informatics
第15週: 05/30 Biodiversity informatics
第16週: 06/06 報告研討
第17週: 06/13 期末報告
第18週: 06/20 停課

有關本學期的課程設計與教材

首先我說明一下為什麼這門課叫Systematic Biology. Systematic Biology這個學門包含與涉及了以下領域:

• 分類學(Taxonomy),
  
• 系統分類學(Systematics),
  
• 形態學(Morphology),
  
• 古生物學(Paleontology),
  
• 親緣關係學(Phylogenetics, 或稱系統發生學),
  
• 分子演化(Molecular Evolution),
  
• 族群遺傳(Population Genetics),
  
• 演化生態學(Evolutionary Ecology),
  
• 生物地理學(Biogeography),
  
• 演化基因體學(Evolutionary Genomics),
  
• 演化發育學(Evo-Devo),
  
• 演化運算學(Evolutionary Computation), 與
• 生物多樣性資訊學(Biodiversity Informatics)

以上這些領域在Systematic Biology中扮演不同的角色, 有些是主體, 有些是工具, 而每一個領域亦有各自的議題發展與方法論. 在Wikipedia上可能沒有Systematic Biology這個詞條的詳解, 我參考美國系統生物學會(Society of Systematic Biologists)及其與Oxford University Press合作發行的重量級期刊Systematic Biology的說明: systematic biology includes the theory, principles, and methods of systematics as well as phylogeny, evolution, morphology, biogeography, paleontology, genetics, and the classification of all living things. 所以呢, 這個課程就會包含幾個大部份:

• 人類對發掘與探索新生物與生命現象的歷程
• 為什麼要對地球上的生命進行分類?
• 如何定義一個物種?
  
• 為什麼需要推測生物類群間的演化關係?
• 我們需要什麼樣的資訊才能進行這樣的推測?
• 我們可以使用生物的親緣關係進行什麼進一步的研究與應用?
• 這些知識對於普羅大眾, 教育工作, 解說教育, 科學研究有什麼樣的重要性?
  

但是呢, 這個課程的課程目標沒有非常遠大, 也沒有那麼複雜, 如果把Campbell普通生物學唸好的同學就會發現, 這不就是普通生物學的Evolution, Population Genetics與Orgnism Diversity的範疇嗎? 是的. 我們打算從普通生物學的架構深入這些議題, 也希望修課的同學能夠理解, 探索, 並發掘學習生態與演化科學的樂趣. 這門課沒有單一的課本, 所以修這門課的同學就要學著跟著課程議題主動地閱讀文獻, 而不能被動的讓老師餵講義給你吃. 我的課一定沒有講義, 這也不是必修課, 所以想湊學分的人千萬不要來修以免感到痛苦在地上打滾. 有一些中文的入門書(不是課本喔), 在此建議同學翻閱(有一種東西叫圖書館, 然後我也很討厭動不動就說"人家找不到"的學生), 我很可能會在上課的第一節就與同學討論這幾本書, 在我的課上, 經常與我討論的就是好學生, 完全不討論也被動的就是不應該來修的學生. 所以想修的同學請一定要花時間準備.

• 博物學史: 植物獵人
  
• 博物學史: 台灣植物探險
• 博物學史: 台灣動物探險
• 博物學史: 台灣森林探險
  
• 博物學史: 台灣昆蟲學史話
  
• 演化學發展: 達爾文的秘密花園
  
• 演化學發展: 達爾文與小獵犬號
• 族群遺傳學: 族群遺傳學導論
  
• 演化學概念: 物種起源
  
• 演化學概念: 演化, 一個觀念的勝利
• 演化學概念: 盲眼鐘錶匠
• 系統分類學: 動物命名的故事
• 系統分類學: 植物命名指南
  
• 親緣關係學: 支序學派大全
• 演化發生學: 蝴蝶、斑馬與胚胎：探索演化發生學之美
• 演化生態學: 紅色皇后
  
• 演化生態學: 第一隻眼的誕生
• 演化生態學: 達爾文的夢幻池塘
• 演化生態學: 我們的身體裏有一條魚
  
• 生物地理學: 生物地理學
  

本學期課程之facebook社團已建置好

網址在此, 請修課同學加入, 以免開學了又說沒收到通知喔