台大生演所胡哲民老師研究室所整理的分子演化及演化生物學中文名詞整理

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生殖器的演化：理論、證據與新的思考方向

William G. E. 2010. Evolution of genitalia: theories, evidence, and new directions. Genetica 138: 5-18

有許多假設用來解釋為何在各類群的動物中，雄性外生殖器的演化速度似乎都明顯高於其他特徵。其中最重要的兩個理論是性擇（sexual selection）中的：兩性對抗的共演化（sexually antagonistic coevolution，SAC）與隱性雌選擇（cryptic female choice，CFC）。然而，本文作者在經過更仔細、更多方面的探究之後卻發現，SAC並不非生殖器演化的主要推手。作者認為，未來應該進行更多直接針對CFC的試驗，並對研究雄性外生殖器型式與雌性感覺能力的實驗進行修正，並進一步分析兩性在交尾時可能的互動及直接觀察其生殖行為才能有助於釐清這個問題。

Abstract
Many hypotheses have been proposed to explain why male intromittent genitalia consistently tend to diverge more rapidly than other body traits of the same individuals in a wide range of animal taxa. Currently the two most popular involve sexual selection: exually antagonistic coevolution (SAC) and cryptic female choice (CFC). A review of the most extensive attempts to discriminate between these two hypotheses indicates that SAC is not likely to have played a major role in explaining this pattern of genital evolution. Promising lines for future, more direct tests of CFC include experimental modification of male genital form and female sensory abilities, analysis of possible male–female dialogues during copulation, and direct observations of genital behavior.

本課程上課地點為生科館5013室

• 每次上課9:00整開始
• 上課地點為生科館5013室
• 修課同學應加入facebook的生態演化文獻俱樂部
  

系統生物學第二次上課所需進行的準備

第二次上課前, 同學應該要溫習普通生物學中有關"the origin of species", "population genetics", "the tree of life"這部份的章節. 並事前提出疑問.

貝氏演算法建構親緣關係，以及其對於昆蟲分類的影響

Source:Ronquist F & Deans AR (2010) Bayesian Phylogenetics and its influence on insect systematics. Annu. Rev. Entomol. 55: 189-206. [abstract]

[簡介]

貝氏演算法(Bayesian inference, BI)是一種基於馬可尼可夫鏈以及條件機率的演算法，自1990年代中期開始應用在親緣關係的建構上，特別是以分子資料為基礎資料矩陣；其優點在於相較於其他的演算法，貝氏演算法能夠以更快的速度建構出親緣關係。本篇回顧性的文章評估自1990年開始使用貝氏演算法後，對於昆蟲系統分類的影響，以及不同的模型與參數對於不同昆蟲分類群的應用與適用度。

寒假預修時程安排

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[書介]支序學派大全

• ISBN 978-957-8596-25-2
• 書名 支序學派大全
• 作者著者／E.O. 懷利、 D.R. 布魯克、 D. 西戈爾、 V.A. 芬克 等
• 合譯／陳星玉、陳小平
• 審定／邵廣昭
• 出版 1995.12.
• 頁數 215 頁 14.8cm x 21cm 平裝
• 價格 NT$350
• 書介 作者著《PHYLOGENETICS》自 1981 年出版以來，受到《NATURE》及《SCIENCE》期刊的推崇，認為該書是世界支序分類學《CLADISTICS》的標準教科書之一。本書是系統發育系統學 ( 分支分類學 ) 領域重要著作。著者不但整理了有關支序學派的基礎理論與實作方法。同時提供大量的範例與練習，使讀者可以無師自通。本書適合系統分類學 (包活動物、植物、微生物) 與探討演化有關的生物科學研究人員、大專院校師生及博物館專業人士參考。漢文版並有英漢術語對照。
• 評語 這本書被台灣很多開授系統分類學的老師採用, 但我實在要說的是, 這本書的中文翻譯得很不好, 非常不通順, 看了會頭痛+眼睛痛, 但有一些基本概念是可以看一看, 不過我個人的建議是一定要輔以網路上的資訊以及這本原文課本Cladistics: the theory and practice of parsimony analysis閱讀才能正確瞭解.