系統生物學2010年下學期課程綱要

課程大綱 (扣除期中考與期末考約16週課程, 課程內容與進度將視修課人數與學生程度調整)

1. 系統生物學簡介與課程介紹 (寒假進度)
   
2. 趨勢: 系統分類學發展回顧 - 從亞里斯多德到DNA條碼 (寒假進度)
   
3. 趨勢: 演化生物學發展回顧 - 由古典遺傳學到功能基因體學 (2/24)
   
4. 趨勢: 演化生態學發展回顧 - 以演化架構探討任何層級的生態議題 (3/3, 案例說明)
   
5. 趨勢: 應用演化學發展回顧 - 演化生物學的預測價值如何在日常生活中發揮作用 (3/10, 案例說明)
   
6. 理論: 親緣關係重建理論的演進 - 表型學派 (3/17)
   
7. 理論: 親緣關係重建理論的演進 - 支序學派 (3/24)
8. 測驗: 表型學派與支序學派的基礎概念 (3/31, 老師出國)
   
9. 實作: 表型學派與支序學派的比較與演練 (4/7)
   
10. 理論: 分子演化與分子遺傳的基礎理論 (4/14)
    
11. 實作: 分子系統發生學的基礎邏輯與演練 (4/21)
    
12. 期中口頭報告 - 對以上練習結果的呈現與分享 (4/28)
    
13. 哲學: 生物的命名規約與系統分類架構 (5/5)
    
14. 趨勢: 系統生物學研究所面臨的文化與政治議題 (5/12)
    
15. 趨勢: 博物館, 學校, 與研究機構的角色 (5/19)
    
16. 生物多樣性資訊學對演化及系統分類研究的衝擊與刺激 (5/26)
    
17. 期末口頭報告 - 對一個演化或系統分類議題的綜合評述 (6/2)
    

課程目標 系統生物學是在演化學、親緣關係與系統分類的架構下瞭解生物多樣性的一個學門。這門課程的目標是協助學生對這個生物領域進行深刻的瞭解，並能夠進行嚴謹的討論。這門課的前半部份將介紹系統生物學的基礎歷史、任務、原理以及基本的操作。後半段將介紹主要的方法論、基礎應用以及未來的發展趨勢。

參考書籍 (請至老師的anobi書櫃觀看)

• Forey, P.L., Humphries, C.J., Kitching, I.J., Scotland, R.W., Siebert, D.J. & Williams, D.M. (Eds.) 1998. Cladistics: a practical course in systematics. Systematics Association Publication 10. Oxford University Press, Oxford.
• Hall, B.G. 2001. Phylogenetic Trees Made Easy. Sinauer, Sunderland, Massachusetts.
• Hill, D.M., Moritz, C. & Mable, B.K. (Eds.). 1996. Molecular Systematics. Sinauer, Sunderland, Massachusets.
• Humphries, C.J. & Parenti, L.R. 1999. Cladistic Biogeography (2nd edition). Oxford Biogeography Series No. 12. Oxford University Press, New York.
• Quicke, D.L.J., 1993. Principles and Techniques of Contemporary Taxonomy. Tertiary Level Biology Series. Kluwer Publishing Group.